Seit dem 1. Januar 2006 ist der wirtschaftliche Geschäftsbetrieb der Alemannia in einer Tochtergesellschaft, der Alemannia Aachen GmbH, ausgelagert. Dem Beispiel zahlreicher Bundesligaklubs folgend, sind in der Gesellschaft alle Mannschaften von der U13 aufwärts bis zur Profimannschaft zusammengefasst.

Die Rechtsform der GmbH bietet im Vergleich zur Aktiengesellschaft oder Kommanditgesellschaft eine einfache Struktur. Außerdem soll kein zusätzliches Kapital beschafft, sondern die Haftungsrisken für die Alemannia und deren Vorstände minimiert werden. Auch wenn es gesetzlich bei einer GmbH nicht vorgeschrieben ist, gibt es laut Satzung einen Aufsichtsrat, der aus drei Vorstandsmitgliedern der Alemannia sowie bis zu vier von der Mitgliederversammlung zu wählenden Aufsichtsräten besteht.

Der Aufsichtsrat bestellt den oder die Geschäftsführer und kontrolliert diese. Die Richtlinien zur Geschäftsleitung durch den/die hauptamtlichen Geschäftsführer und insbesondere der Etatplan werden vom Aufsichtsrat genehmigt und die Einhaltung überwacht. Der Aufsichtsrat informiert die Mitgliederversammlung des Vereins – wie bisher der Vorstand – über die Entwicklung und den wirtschaftlichen Erfolg der Fußballabteilung.

Die Aufsichtsratsmitglieder aus dem Vorstand des Vereins stellen sich alle drei Jahre, die unmittelbar von den Mitgliedern zu wählenden Aufsichtsräte alle vier Jahre der Mitgliederversammlung zur Wahl.

Der TSV Alemannia Aachen 1900 e.V. besteht mit den Abteilungen Frauenfußball, Handball, Leichtathletik, Tischtennis, Volleyball und Fußball-Jugend bis zur U12 weiter.